Michael Behe po mistrzowsku rozpracował tego typu paplaninę! Jest też na temat rzekomych neodarwinowskich dowodów na ewolucję kaskady krzepnięcia krwi i na to, że ten system jest redukowalnie złożona! 🙂
Uczyniłem tekst bardziej przejrzystym. Tłumacze na przykładzie elementów silnika bakteryjnego, ale mogę podstawić każde białko każdego innego złożonego kompleksu molekularnego:
https://biology.stackexchange.com/questions/49209/how-did-the-cardiovascular-system-evolve
„Trudność stworzenia modelu teoretycznego ewolucji w przypadku niektórych systemów molekularnych polega na tym, że interakcje między tworzącymi je częściami są ściśle zintegrowane. Bardzo prostymi przykładami mogą być białka, które aktywują/dezaktywują inne białka (np. przez fosforylację). Wtedy teoretycznie moglibyśmy uzyskać taką sytuację:
Końcowy system (4) wygląda na nieredukowalnie złożony, ponieważ nie można z niego usunąć żadnego z elementów (A, B, C, D) bez przerwania cyklu i utraty funkcji. Jednak na każdym kroku dodawaliśmy, lub usuwaliśmy tylko jeden element. Pokazuje to również znaczenie redundancji w systemach biologicznych. Jeśli usuniesz C lub D z systemu (3), to nadal działa.
[….]Jeśli mamy system, w którym A zależy od B i C, B zależy od A i C, a C zależy od A i B, to moglibyśmy dodać D, który zależy od A, ale nie możemy sprawić, by A także zależało od D. A może włączyć D do swojej funkcjonalności, ale nie zależy od tego. D może zostać usunięty, a A nadal będzie działać. „
http://parts.igem.org/Part:BBa_K557000
„Fosfataza CheZ defosforyluje białko CheY-P i tym samym odgrywa ważną rolę w chemotaksji E. coli. Fosfataza CheZ defosforyluje CheY-P powodując obrót wici przeciwnie do ruchu wskazówek zegara. E. coli pozbawione genu cheZ nie mogą defosforylować CheY-P, a zatem są nieruchome. Indukowanie ekspresji CheZ może przywrócić ruchliwość w szczepie z nokautem CheZ przez reaktywację chemotaksji typu dzikiego.”
https://www.cell.com/trends/microbiology/fulltext/S0966-842X(20)30081-0
- Obrót silnika wici bakteryjnej jest generowany przez interakcję między dwiema częściami w silniku, wirnikiem i stojanem. Wirnik składa się z centralnego pręta i otaczających go pierścieni, a stojan jest jednostką, która działa jako konwerter energii, aby sprzęgać dopływ jonów z obrotem wirnika.
- Napędzany Na + silnik wiciowy w Vibrio alginolyticus , którego prędkość obrotowa jest większa niż w jakimkolwiek silniku napędzanym H + , zawiera PomA/PomB jako białka stojana i kilka dodatkowych struktur podobnych do pierścieni, T-, H- i O -pierścienie, których nie ma w silnikach z napędem H + .
- Montaż stojanów PomA/PomB w silniku zależy od stężenia Na + w środowisku . W obecności sodu region peryplazmatyczny stojana zmienia swoją konformację do postaci aktywowanej, która wiąże się z peptydoglikanem, a naładowane reszty w regionie cytoplazmatycznym oddziałują z naładowanymi resztami w białku FliG wirnika, aby wytworzyć siłę rotacyjną.
- FliG dynamicznie zmienia swoją konformację, aby zmienić kierunek obrotów silnika w odpowiedzi na sygnał chemotaktyczny przekazywany z drugiego komponentu wirnika, FliM, który wiąże się z białkiem regulatorowym odpowiedzi chemotaksji CheY.
http://tele-lekarz.pl/Biologia/Chemotaksja-Bakterii-Ang-Bacterial-Chemotaxis/
'Chemotaksja (Chemotaxis) Ruch bakterii w kierunku specyficznych substancji oraz ruch oddalający bakterie substancji toksycznych nazywa się chemotaksją. Chemotaksja dodatnia jest to zjawisko podążania bakterii urzęsionych w kierunku składników pokarmowych, czyli atraktantów. Chemotaksja negatywna jest to ruch bakterii urzęsionych oddalający je od związków toksycznych, czyli repelentów. Zachowanie chemotaktyczne jest uzależnione od poziomu metylacji tran-sbłonowych białek receptorowych (chemoreceptory) wiążących bodźce, co wywołuje zmiany ich konformacji przekazywane do domen regulatorowych białek (CheY, CheR) aparatu motorycznego rzęsek. W czasie poruszania się po linii prostej czyli biegu, wiązka rzęsek porusza się w kierunku przeciwnym do ruchu wskazówek zegara. Koziołkowanie spowodowane jest gwałtownym odwróceniem kierunku działania aparatu motorycznego rzęsek, co powoduje chwilowe rozplecenie wiązki rzęsek. Regulacja częstości koziołkowania ma w chemotaksji zasadnicze znaczenie. W obecności substancji działających chemotaktycznie zmniejsza się częstość koziołowania, wydłuża się ruch po prostej i mimo krótkich ruchów w różnych kierunkach, ogólny ruch wypadkowy jest w określonym kierunku.'
http://pandasthumb.org/archives/2008/05/behe-vs-lamprey.html
„Minoogowi, rybie bezszczękowej brakuje czynników IX i V . Są to ważne elementy kaskady krzepnięcia krwi, bez których mogą się obejść. Kiedy okazało się, że wielorybom i rybom kostnoszkieletowym brakuje wewnątrzpochodnego układu krzepnięcia krwi, Michael Behe stanowczo stwierdził: „ Tym gorzej dla nich ”. U ludzi brak czynnika IX powoduje zaburzenie krzepnięcia zwane hemofilią B , brak czynnika V powoduje również hemofilię, a brak obu z nich skutkuje ciężkom skazą krwotoczną.
Ryby kostnoszkieletowe i bezszczękowe mają zredukowany zestaw czynników krzepnięcia krwi w porównaniu do ssaków. Rybom bezszczękowym brakuje czynników IX i V. Czynnik tkankowy i czynnik VII bezpośrednio aktywują trombinę. Kaskada krzepnięcia jest inicjowana przez współdziałanie czynników IX i V.
Konsekwencje tego faktu dla „nieredukowalnej złożoności” są daleko idace.”
https://www.researchgate.net/profile/Stefan-Freund/publication/230790288/figure/fig2/AS:667133386162201@1536068402870/A-schematic-representation-of-the-blood-coagulation-cascade-Thrombin-is-the-central.png
Does Intelligent Design Rule Out Evolution?
http//www.nauka-religia.uz.zgora.pl/index.php?action=tekst&id=70
Kaskada krzepnięcia. Białka – czynniki krzepnięcia w kaskadowej reakcji doprowadzają do przekształcenia nieczynnego fibrynogenu w sieci fibryny:
https://associationofanaesthetists-publications.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/anae.13480
(a) Aktywacja białka C przez trombinę na błonie komórek śródbłonka. (b) Aktywowane białko C wiąże się z białkiem S i wygasza wytwarzanie trombiny
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.07.414631v1.full
http://2009.igem.org/Team:EPF-Lausanne/LOVTAP
Aby organizmy mogły się rozwijać w zmieniającym się środowisku świetlnym, wyczuwają światło i na nie reagują: informacje sensoryczne pozwalają im poruszać się w odpowiedzi na ten bodziec. W odpowiedziach tych pośredniczą fototropiny , które są fotosensorycznymi białkami składającymi się z domeny kinazy serynowo-treoninowej i pary nieidentycznych domen wrażliwych na światło, tlen lub napięcie (LOV), które zawierają niekowalencyjnie związany mononukleotyd chromoforu flawiny (FMN).
https://quizlet.com/372734106/anticoagulants-flash-cards/
file:///home/slawek/Pobrane/hemereview.pdf
https://fpnotebook.com/hemeonc/Exam/CltngPthwy.htm
http://bio.sunyorange.edu/updated2/comparative_anatomy/anat.html1/C_BLOOD.htm
https://biology.stackexchange.com/questions/49209/how-did-the-cardiovascular-system-evolve
https://www.wjgnet.com/2218-4333/figures/v5/i5/908.htm
https://www.stago.com/haemostasis/history-of-coagulation/
https://www.sciencedirect.com/topics/engineering/coagulation-cascade
https://www.bjanaesthesia.org/action/showPdf?pii=S0007-0912%2817%2937146-5
Stator
https://d-nb.info/1176255487/34
https://phys.org/news/2016-09-japanese-team-elucidates-bacterial-flagellar.html
https://journals.plos.org/plosone/article/figure?id=10.1371/journal.pone.0123518.g001
https://www.nature.com/articles/s41467-021-23516-y
https://www.cell.com/trends/microbiology/fulltext/S0966-842X(20)30081-0
https://www.nature.com/articles/s41467-021-23516-y
https://www.cell.com/structure/references/S0969-2126(16)30396-3
https://www.cell.com/trends/microbiology/fulltext/S0966-842X(20)30081-0
https://www.cell.com/structure/comments/S0969-2126(18)30056-X
Pierścień
https://journals.asm.org/doi/10.1128/mBio.03199-20
https://www.nature.com/articles/s41564-020-0703-3?proof=t
https://www.news-medical.net/health/Science-of-Metabolism.aspx
Cykl ATP – ADP (difosforan adenozyny). Trójfosforan adenozyny (ATP) to organiczna substancja chemiczna dostarczająca energii komórkom. wewnątrzkomórkowy transfer energii.
Montaż i stechiometria struktury rdzeniowej kompleksu bramek eksportowych wici bakteryjnej typu I
https://d-nb.info/1176255487/34
https://elifesciences.org/articles/61446
Silnik wiciowy Vibrio alginolyticus ulega poważnej przebudowie strukturalnej podczas przełączania rotacyjnego
przyroda
@biologia_niedarwinowskie_mechanizmy_adaptacyjne 
Musisz się zalogować aby dodać komentarz.